夢を見ている間、脳は「記憶の固定化」として知られるプロセスを行っており、その日中に取得した情報を処理して記憶します。明晰夢は意識と制御の感覚を高め、夢と現実の混乱につながるため、目覚めたという誤った印象を引き起こす可能性があります。
夢を見ることに関連する睡眠段階であるレム睡眠（急速眼球運動）にも、随意筋の一時的な麻痺が伴います。この麻痺は夢を実現することを妨げ、夢の鮮明さと明晰さに寄与すると考えられています。レム睡眠中にこの麻痺が完全に解除されない場合、誤った覚醒が引き起こされる可能性があります。起きている感覚と夢の非現実的な環境の間の混乱により、ある夢から目覚めた後、別の夢の中にいたような感覚が生じることがあります。